学校注意现代科学基础知识教学,理化仪器、生物标本和实验设备都比较好,并且有一支业务优秀、专心教育的师资队伍(许多教师后来成为大学教授,在科技、学术领域里取得了卓异的成绩),他们知识渊博,治学严谨,作风朴实,不仅为国家和民族培育出许多基础扎实的优秀人才,而且在学生中培养起尊敬师长、刻苦读书、生活勤俭的良好风气,逐步形成了辅大附中的传统校风。
在全面实施素质教育的过程中充分发挥德育、教学、综育、后勤各部门作用,形成了以计算机网络教学为主,同时运用其他现代化手段的电教特色;以环境保护为主题的实现可持续发展的环境教育特色;以"双拥共建"为龙头利用学校周边教育资源的社区教育特色。尤其是在深化课堂教学改革中因材施教,实行"分组选层制"课堂教学模式;深化考试改革,实行"满意考试制";深化作业改革,布置综合性、专题性作业,培养学生的创新能力。
环境优美、设施先进、师资雄厚、教学优良的北京市示范性普通高中校十三中学,面对新时期发展的需要,秉承辅仁附中"公诚勤朴"的校训精神,继往开来,确立了"以人为本,为学生成长、教师成才服务"的办学思想,在建设技术环境和人文环境中,充分体现教育关怀、教育平等、相互尊重和绿色教育等办学理念,为学校教育教学创设了和谐、宽松、愉悦的氛围。学校教学成果显著,高考成绩稳定在市、区较高水平,并多次进入北京市前十名行列。学校正在新课改的基础上,全面实施素质教育,全面提高学校的工作质量。学校注重培养学生的综合素质和创新能力,在高一年级开设意大利语、日语、俄语、韩语选修课,在高二年级开设英语口语课。学校坚持"德育为首,教学为中心"的办学方针;形成了以课堂教学改革和德育特色班建设为主,学习方法指导与学生自我教育相结合的教育教学特色。