学校突出外语、科技、环境和艺术教育特色，尤其是外语。一方面开设了英语、俄语、日语等多种外语课程，2009年已开设法语(现有初中09届一个班，由于是本校高新部第一个以法语为主的班级，开设之初举校哗然，听说已为他们准备将来就读一法国大学);另一方面，英语教育在课程、教材、课时、教法及评价等方面进行了大胆的探索和改革。学生听说读写等英语应用能力十分突出，有百余名学生在广东省、全国乃至国际英语竞赛中获得特等奖、一等奖、二等奖的好成绩。《光明日报》、《中国教育报》、《大公报》、《香港商报》、《深圳商报》、《深圳晚报》等传媒多次对该校的英语教育特色及成果作了报道。另外，在突出办学特色的同时，学校非常注重全面培养学生的综合素质，注重全面提高教育教学质量，现在该校的小学和初中早已是深圳市知名的教育品牌，高中今年首届高考，也首战告捷，各项指标均超额完成任务，创造了“低进高出、高进优出”的骄人成绩，深受学生、家长、社会、同行以及主管部门的高度赞誉和一致好评。
南山外国语学校办学以来，在学制、课程、教材、教法上作了大胆的改革和探索，形成了英语、科技、艺术三大教育特色，使学生的综合素质和个性特长、学习能力和创新能力得到了很好的发展。
目前，学校实行国家课程和校本选修课程相结合，长短课相结合。部分年级实行分层次教学。学校部分选用境外的原版英语的科技教育教材，还率先在国内自编了《环境教育》教材。在教法上，摸索出一套合作式、创造式、活动式、探究式的课堂教学模式。现在，学生英语应用能力十分突出，近百名学生在深圳市、广东省，全国乃至国际英语竞赛中获得好成绩，科技、艺术教育特色也初见端倪。各传媒多次对学校教育特色及成果予以报道。
多年来，学校十分重视对外交流与合作，先后已与澳大利亚的威廉莱特学校(WILLIAM LIGHT SCHOOL)、新西兰的远极学校(RANGITOGO COLLEGE)、英国的圣·爱德蒙学校(ST.EDMUND’S COLLEGE)、美国加利福尼亚州的林肯中学(LINCOLN MIDDLE SCHOOL)、爱尔兰布鲁斯学院(Bruce College )德国的KGS Neustadt等建立了姊妹学校关系，开展了广泛的交流与合作。
深圳市南山外国语学校，这所年轻的、绿色的、充满活力的、富有特色的学校，正和新一轮课程改革—道成长;以精心的规划、精细的管理、精干的领导团队、精美的文本系统、精良的教学设施、精深的文化积淀、精彩的校园生活、精湛的教艺、精英的学生，打造精品学校，信心百倍地向“跻身全国知名外语学校行列”迈进!
